GCW_01360







Uniprot: A0A0F6CKB4
Description: DNA polymerase III subunit epsilon
EC number: 2.7.7.7
Annotation score: 2 out of 5
Miscellaneous [CC]: 
Protein existence: Inferred from homology
Catalytic activity: CATALYTIC ACTIVITY: Deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1). {ECO:0000256|SAAS:SAAS00057091}.
Cofactor: 
Enzyme regulation: 
Function [CC]: 
Pathway: 
Active site: 
Binding site: 
Calcium binding: 
DNA binding: 
Metal binding: 
Nucleotide binding: 
Site: 
Gene names (primary): dnaE
Gene names (synonym): 
Mass: 117,828
Subunit structure [CC]: 
Gene ontology (GO): 3'-5' exonuclease activity [GO:0008408]; DNA binding [GO:0003677]; DNA-directed DNA polymerase activity [GO:0003887]; DNA replication [GO:0006260]
Gene ontology IDs: GO:0003677; GO:0003887; GO:0006260; GO:0008408
Chain: 
Signal peptide: 
Domain [CC]: 
Sequence similarities: SIMILARITY: Belongs to the DNA polymerase type-C family. {ECO:0000256|SAAS:SAAS00558490}.
Protein families: DNA polymerase type-C family
Coiled coil: 
Domain [FT]: DOMAIN 3 71 POLIIIAc. {ECO:0000259|SMART:SM00481}.
Motif: 
Region: 
EMBL: CP006916
ProteinModelPortal: 
MEROPS: 
EnsemblBacteria KO: AHB99536
UniPathway: K02337
CDD: 
Gene3D: 
HAMAP: 
InterPro: 
PANTHER: IPR011708;IPR029460;IPR004013;IPR003141;IPR016195;IPR004805
PIRSF: 
PRINTS: 
PROSITE: 
Pfam: 
ProDom: PF07733;PF14579;PF02811
SMART: 
SUPFAM: SM00481
TIGRFAMs: SSF89550

In one protein complex with GCW_03210 GCW_04050 GCW_03395 GCW_04080 320867-323939(+)

>nucleotide sequence
ATGTTTGTCAATTTAAATACTCGATCTTACTACTCTTTATTAAGCACTAATCTAAGCATT
AGTGAGATTATTGACTTTGCTGTCAAGAATAATCAAACCCACGTTTGCTTAACCGATTTA
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AATAATTCTGGTTATCTTAATCTAATTAAGATTAGTAGTTTTGCTTCTAGTAACCTTGAT
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AAGTGAGATCATGTTAATTGTCTTAAGAAAAAAGAACTAGCTTTTAACTTTGTTAATTGT
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GGCAAAAGATCTAAATTTCAGATCGATGAGTTATATAATTCCCAACTTGTTTTAGCTAGT
CCTTTTTTAAGTACAGAAAAAGCTAAAAAACAATTTTCACAAAAACAACTAGATAAATTA
AATGATTTAGTTCAACAGTGTTCAGGTTGAGATCTTGATAATCTAACCAAAAATTCAATC
ATTAAATATCACACCGTTAAAGAGTTTGATAGTGATCAATATTTAGTTGAACTGTGTCAA
ACTAGATTTAATGACTTATTAAACAAAAGATTAATTAGAGCTAGTGACCAAAAACGTTTA
AACTACGAACTAGCAATCATTAAAAAACTTAATTTTAGTGATTACTTCTTGTTTGTTTAT
GATTTTATTAATCATGCTAAACAACAAGGGATTGTGATCGGTCCAGGGAGAGGTTCAGCT
GCTGGATCGTTTATCTCTTACCTTTTAAATATCACCACGATTAATCCAATTAGCTATGGA
TTAATCTTTGAACGTTTCTTAAACCCCCAAAGAAAAAGCATGCCTGATATCGATGTTGAT
ATCATGGATTCACGACGTGAAGAAGTTGTTGATTACTTATTTAATAAGTATTCTAAAGAT
AATGTTGCCCACATTATTACGTTTCAAAGAATTAAGGTTAAAAATGCGATCAGAGACGTT
TGTCGGGTTTTAGATTTAAAAACTAGTGAAACAGATGAAGTAATTAATTTTGTTTCATAT
GATGAGATATCTGATTGGGAAAAAAACCAAAATGCGACAGCATTTAAGAAAGTGCTTAAT
TGCAATGAGTGCGATTTAGATCAAAAAAAGTGTAAACGTTCAGGCGCTGTTAGTTGTTAT
GTGATTAGCAAGATCTTTGATTTAGCCCGAACGATCTTTAATGTTCCAAGACAGACCGGA
TTACATGCTGCTGGTGTTGTTTGTGGTAATGATGCACTAACTCAAACGATCCCATTGCAA
TATTTAAACAACCGTTCGGTTTCGCAATTTTCAATGGAATATCTCGAACAGTTTGGTTTG
ATGAAGATCGATCTGTTAGGGTTAAAAACCCTAACGATTATTGATGAGATTAATAGTTTA
GTAAAACTAAACTATGATCGTGATTTTGATATCAATAATATCCCACTAAATAATAAGAAC
ACCTTTAATTTATTAAAAAAAGGTTATACCAAAGGGGTGTTCCAATTAGAATCTTTAGGG
ATGCAAAATGTCTTAAAAAAGGTTCTACCAGAATCAATTGAAGATATCTCAATTATCTCA
GCACTATACCGACCAGGTCCCCAAGATAATATTGATGAATATGTCAAAAGACGATTTTCA
AACACCGAATTTGATTACTTAAGTGAAGATTTAATTGAGATCTTAAAACCAACACATGGG
ATCATCATTTATCAAGAACAAGTGATTAACACAGCAATGGCGGTAGCAAATTTTGATGCT
GCACAAGCTGATTCTTTTCGTAGAGCGATCTCTAAAAAGGATGAAGCCTTATTATTAAAA
GATAAGAAGACTTTTATTGAACAAGCGATCAAAAATCGCTATTCAGAACAAAAAGCGTTA
GAGATCTTTGAATACTTACATAAGTTTGCTGATTATGGTTTTAACCATTCTCACTCTTTA
TCTTATGCGTTCTTAGCTTATCAGATGGCCTATCTGAAAGCTAATTATCCCAAAGAGTTT
TATCTGATCTTATTAAAAAACAACGTTGATTCTAAGGTAAAACTCACTGATTATTTCATT
GAGATTATTGAACGCAATATTGGGATCATTAAACCAAATATTAACCTTTCAGATTGATCG
TTTAGTTTAAGCGCTGATCATCAAAAGATCATTCTAGGCTTTAATATGATTAATGGTCTA
GGTAATGAAAATGCCAATAAGATCGTGCAAGCAAGAAATAACAAGCAGTTTGAAAGTTTC
ATTGATTGTTTAATCAATTTAGCAAAAAATGGGATTACTAAAAGTTTATTTGATAAGTTA
GTTAACGTTGGTGTTTTTGATCAATTCAAATTAGAGTTATCTAAAAAAGCGATGAGCGCT
TTAGTTAAATCGTATTTTGATCAGAACGTTGGGTTTAAAAATGATGATGATCTAATCTCA
TATGAAGAGAAAAAAGCGCTTGTTCAATCTAGCTTATTCTTTTTAACTAAAGAACAACCT
GAACTGTTTTTAAATCTTTCTAAAGATGAGCTTATAGCTGAAAACGAATTAGCTGATTCA
TTACTAAAAGTTTCATTTGAAGCGATCAAGAAAAAAGTTTATAAACCAAATATCTTTAAA
AAAGAAATTGCTTTTTTAGAAAAACAGATTAAAGATTTAAAAACAGTGAAGCAACTAAAA
GGTGCACTACAAAAAGAAGTGTGTAGTATCTTAGTGCAAATCAAAAAAGTGGAACTAAAA
AACAAGATCTGAAGATTCACCGTCTTTGATGGTGCATATGAGATTAATGCTAAAGTAAGA
GATAAAAAATTAAGTGATTATCTAACCAACTTCATTAATCAAGAAACAAAATTGATCGTG
CGTTTAGACCATGACCTATTTAGAGGCCATGATTCTTACACCATTTTAGGTGTAATAGAT
ATTTTTAAATAA


>protein sequence
MFVNLNTRSYYSLLSTNLSISEIIDFAVKNNQTHVCLTDLNVLYGAVEFYNLAKKNHLIP
IIGLEIFDHSTNSELVLIAKNNSGYLNLIKISSFASSNLDFDLFKYLDENLFVIVKSGDF
KWDHVNCLKKKELAFNFVNCYDLEKKVGLNVINAVSMKQAGKRSKFQIDELYNSQLVLAS
PFLSTEKAKKQFSQKQLDKLNDLVQQCSGWDLDNLTKNSIIKYHTVKEFDSDQYLVELCQ
TRFNDLLNKRLIRASDQKRLNYELAIIKKLNFSDYFLFVYDFINHAKQQGIVIGPGRGSA
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IFK






















© Fisunov Lab of Proteomics, 2016.