GCW_90501

Uniprot: A0A0F6CLT3
Description: DNA polymerase III, alpha chain, Gram-positive type
EC number: 2.7.7.7
Annotation score: 2 out of 5
Miscellaneous [CC]:
Protein existence: Inferred from homology
Catalytic activity: CATALYTIC ACTIVITY: Deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1). {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356, ECO:0000256|SAAS:SAAS00057091}.
Cofactor:
Enzyme regulation:
Function [CC]: FUNCTION: Required for replicative DNA synthesis. This DNA polymerase also exhibits 3' to 5' exonuclease activity. {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356}.
Pathway:
Active site:
Binding site:
Calcium binding:
DNA binding:
Metal binding:
Nucleotide binding:
Site:
Gene names (primary): polC
Gene names (synonym):
Mass: 173,341
Subunit structure [CC]:
Gene ontology (GO): cytoplasm [GO:0005737]; 3'-5' exonuclease activity [GO:0008408]; DNA binding [GO:0003677]; DNA-directed DNA polymerase activity [GO:0003887]; DNA-dependent DNA replication [GO:0006261]
Gene ontology IDs: GO:0003677; GO:0003887; GO:0005737; GO:0006261; GO:0008408
Chain:
Signal peptide:
Domain [CC]:
Sequence similarities: SIMILARITY: Belongs to the DNA polymerase type-C family. PolC subfamily. {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356}.; SIMILARITY: Contains exonuclease domain. {ECO:0000256|SAAS:SAAS00242420}.
Protein families: DNA polymerase type-C family, PolC subfamily
Coiled coil:
Domain [FT]: DOMAIN 322 391 POLIIIAc. {ECO:0000259|SMART:SM00481}.; DOMAIN 409 588 Exonuclease. {ECO:0000259|SMART:SM00479}.
Motif:
Region:
EMBL: CP006916
ProteinModelPortal:
MEROPS:
EnsemblBacteria KO: AHV85385
UniPathway: K03763
CDD:
Gene3D:
HAMAP: 3.30.420.10
InterPro: MF_00356
PANTHER: IPR011708;IPR029460;IPR006054;IPR013520;IPR004013;IPR003141;IPR006308;IPR012337
PIRSF:
PRINTS:
PROSITE:
Pfam:
ProDom: PF07733;PF14579;PF02811;PF00929
SMART:
SUPFAM: SM00479;SM00481
TIGRFAMs: SSF53098
111892-116377(+)

>nucleotide sequence
ATGAATAAGAAAGAATTAAAAAGTTTTTTTGAAAATCTTAATAATAAATTAGCTATTCCC
AACCCGTTATTAACTTTTCTTAAAAAAAGTACTGTTAGAACGATCAAAAAGATTGGGGAT
AATAAAAAAACCCTTGATCTTAGTTTTATTCTTAACCAACCATTAACCGTTGATTTATAT
CAAACCTACCTTGATTATGTAGCTAACTTTAATAATAAAAGTAAGGATCCTTACTTTCAG
TTTAACTTTATCTTAGATAGCTCATTATGAACTAGTGAATTAATTCAAAGCGCGATCCAA
GAGATCTATAAGAGTGATAAAAACCAGAGTTTTTATGCTGAAGCTATAGAATTGGTTAAC
GAGAAGTTTTATCAGATCGTTTTTAGTAATAAAGAGTTACAACACCAATCTGATCAGCAA
TTAGAATGATTAGTTACTCAATTAGAAAACCTAGGGTTTTATCAGATTAATTTAGCAACA
AAGCTAGATTTAAATTTAGTAGCTATTAATCGTAATAAAGCTGATGAAGAACCAAAAAAA
CCTAAAGCTAGAAGAGTTGTTAAAGAAGATGGTTTTAGTTTAGAAGAATGTTTAGAAAAA
AATAAAATCCTTGATACAAGTGTAATTACTCCAATCAAGGATTTTGATCCGAATCAACCC
ACTTCTTTAACAACTTTATGAGCTAAAATCTATCATTTAGATTACCGTAAAAACGGTACT
AATAAAGCATTAAGATTAGGTTTAGCTGATAAAAATAGCGCTGTTACGATCTTTAGCTGG
ATTACGAGATCTAAACATTTGACCAGTGAATATTTAGAGAATTTTAAAGTGGGTAACTGA
ATTAAAATCCAGTTACGTGTTACTTCTAGTAAGGATGATAAAAAATATACTGAGATCTTA
AGGATCGATCATGCTGAATTGCCAGAATGATTAAAACCTACTCCTGAAGAGTTTACTAAT
CGTCATGAATTCTTTTTTCACACCAAAATGAGTGTCCATGATGGGCTTAATGATGTTGAT
GATTTGAAAAAATTCTGTGAAGAGAACAAATTAAAAGATATCGCGATCACTGATAGTGGG
GTTGTTCAAGCTTTTGCTGATTTAGCTTCATGGAAAGAAAAAACTAATAGTGAAACTAAA
GTCCACTATGGTTTAGAGGTTGATCTTTTTGATGATCGTAATTTTATTGTTAAAAACAAT
AAAGATTTGAAACTAGATAAGTTAAGTTTTGTTATTTTTGATATTGAAACAACCGGGCTT
AATGCTTACTATGAACAGATCATAGAAATTGCAGCTGTTAGGGTTAAGGCTGAACTTAAT
GAAACAAACCACCAACTTGAATTTGTTCAATTAGGAAAATTTGAGAAACTAATTAAGAAT
GAAAAACCGTTATCAAAATTTACGACACAATTAACAGGACTTAAAGATAGTGATCTAAAA
GATGCCCAAGATGAAAAGACGGTATTAGAAGAGTTTGCTAACTTTATTCAAAAAGATGAT
GTTTTAGTTGCACATAACGGAATTGATTTTGACTTTATTTGGATTAATACCAAATTAGAT
AAATACAAATTAAAACCACTTGATAATCCAATGTTAGATAGTTTAAGATTGGCCTATCAA
CTTTATCAATTCAAACGTTATACATTAGAAAACCTTTCACTTAAACTTGGTTATGAATAT
GACAAAACATTAGCACACCGAGCTAATTATGATACTGAACTTTTAGCTAAGTGTTTGATG
ATCATGTTATCACAAATTTATGCTAAAAACTGAAGATCGTTATTAGATTTAAATGATCAA
GAAAAATTATTGAATTATCTTAGTGAAAAATCATTAAAAAAAGCGGCAAATCTTAAGATA
AATGATGAAGATAATCTAGACCAGATCACTCAATCAAATGAGAATTTATTTAACCGTATT
CGGTTAAGAAAAGCGATTGTGTATGCTAAAAACGCTCAAGGTTTAAAAGCACTTTACAAA
CTAGTAAGCTTAGCATCAACAAAACAGTTTTATGGTTCACCAAAGTTATTTTGGTCTGAT
CTTGAAAAATATCAAAATGATCTTTTAATCTCTTCTCACCCAATTAACGGGCATATCGTT
CATGCTGCTAAGTATGATACGAATGAAAATCTAAGAAAACTAATTAAAAAACATAGCTTT
GTTTTAGTTCCTTTACCTTCATTATTTAAGCAAGATCTTTACAAAAAAAATATTGAACTA
ACTCATGTTCATGATTTAATTAATCGAATTATATCAATCTGTGAACAAGAAAAGATCTTA
TATACTTTCAGTTCAGCTGCACACTACCTAAAACAAGAACAAAAACGATTCTATGATTGT
TTAATAACAGCAGAAATCACCGGTAAAAAGTTACATCATTTCTATGATCGTGATCTATCA
ACAAACCAAAATGTTCCCGATCTACACATTCGTAAGAATAATGAAGTTTATCATGATTTT
AGTTTTATCCAAGATCAAGAGATCTTAGAAAAACTAATCTATCGTAATGGTGAAAAGATT
GCTAACTTATTTAATGATGAAGGTCTATTACCATTTCCTAAAAAATTACACCCACCTAAG
ATTGAAGGATCAGATGATAAACTCATTGAATTAGTCTGAAATAAAGCTAAGGAATTATTT
GGGGATGAGATTGATCCTATCATCAAATCAAGAATTGAATACGAACTAAACGCAATTATT
AAAAATGGCTATGGGATTATTTATTGATTAGCTCATCTACTAGTTAAAAAATCTAATGAT
GATGGTTATTTAGTAGGTTCACGTGGTTCTGTTGGTTCATCGATTGTGGCATTACTAGCA
GGAATCTCAGAGGTTAATCCGTTACAACCGTATTATTATTGCAAGAAATGTAAAAAAACT
AAGTTTGTCGATAATGTTGATGATGGTCATGATTTAGTTAACAAACCATGTGAGTTCTTA
GATTGTGATGGTGAGATGAGAGGTGAAGGACATAATATCCCATTTGCTTCATTCATGGGA
TTCAAAGGTGAAAAGACTCCTGATATCGATCTCAACTTCTCAAGTTTTTATCAAGCTAAA
GCTCACGATTATGTACGTGAACTGTTTGGTGAATCCCACACCACTAGATGTGGAACGATC
TCAACGATGCAAGATAAAACAGCATACAAGATTGCCAAAGATTATCTTGAAATAACTATT
GGTGAAGAAGAATCTGAACGTTTAGCTGGATGATATGCTTCTGAGATGAGCGAGATCAAA
AGAACAACCGGACAACATCCTGGTGGGATCTTAGTTTTCCCCAAAGATAAAGAAATCGAA
GATTTCTGTCCGGTTAACTATCCAGCCGATGATAAATCATCAAAATGAAAAACATCACAC
TTTAAATTTGAATACTTACATGACACTTTATTAAAGTTAGATATCTTATCTCAAGAAGAC
CCAACGATCTTAAAGTATCTTTATGAGATTACAAATGTAAAACCTGAAGAGATTCCCAAT
AACGATCCCAAGGTTTTATCACTATTTAATTTAGACCATTGTCTTGAAAACGTTAATAAC
AACCCAATCTTAAAAGATTCAACTGGAGCACTAGGGATCCCTGAGTTTGGTACAAAAATT
ACTCGGGAGATCTTAAAGATTGCCAAACCAGCATCAGTAGCTGATCTAATCCGGGTATCT
GGATTAAGCCATGGTACTGATGTTTGAACCAATAATGCGGCTGATCTAATCGTTGATAAG
CATTATAAACTTAATGAAGTAATTGCTTGTCGTGATGATATTATGACCTATCTTAGTTCG
TTAGGAATTGAGAACCAGATCGCATTTAATATTATGGAAGATGTAAGAAAGGGTAAGAAG
CTTAAACCTGAGTATGAAAAGATCATGCAAGAATTTAATGTCTCACAAGATTACATTGAT
TCATGTAATAAAATTAAATACATGTTCCCAAAAGCTCACGCGACTGCGTATGTTTTAATG
GCATGAAAAATTGCTTGATTTAAGGTTCATTATCCTGAAGCATTTTATGCAGCCATCTTT
TCATTTAAAGTTAAAGAACATGATATAGAAACCTGTATTAATGGTGGGATTAGAGCTATT
ACCAAACGTTATAACGAGATTAAATCATTAATTAATAAGACTAAGTTTGCTAAAAACAAA
AGTGAATTAACACTAAATAAAAAAGATGAAGATCTAATGCCAACATATGAACTTTATCTA
GAGATGTTAGAACGTAATATTAAACTTGAACAAGTTAGTCTTGAACATTCTGATGCCTTA
CATTTTGTTGTTAAAAACAACAAGATCTACCCACCATTTAATACGATTAATGGTTTGGGT
GATGAAATTGCCAAACTAATCGTTAAAAAACGTAACGAAGAAGGGTTTAAATCTCAAGCA
GATTTAAAGACAAAATGTAAGTTGAATAAGAATATTTGAAACTACTTTATCACCTATCAA
GTCTTTGGCGACTTGAAAGAAGATGAAAAAATTCGCTTATACTAA

>protein sequence
MNKKELKSFFENLNNKLAIPNPLLTFLKKSTVRTIKKIGDNKKTLDLSFILNQPLTVDLY
QTYLDYVANFNNKSKDPYFQFNFILDSSLWTSELIQSAIQEIYKSDKNQSFYAEAIELVN
EKFYQIVFSNKELQHQSDQQLEWLVTQLENLGFYQINLATKLDLNLVAINRNKADEEPKK
PKARRVVKEDGFSLEECLEKNKILDTSVITPIKDFDPNQPTSLTTLWAKIYHLDYRKNGT
NKALRLGLADKNSAVTIFSWITRSKHLTSEYLENFKVGNWIKIQLRVTSSKDDKKYTEIL
RIDHAELPEWLKPTPEEFTNRHEFFFHTKMSVHDGLNDVDDLKKFCEENKLKDIAITDSG
VVQAFADLASWKEKTNSETKVHYGLEVDLFDDRNFIVKNNKDLKLDKLSFVIFDIETTGL
NAYYEQIIEIAAVRVKAELNETNHQLEFVQLGKFEKLIKNEKPLSKFTTQLTGLKDSDLK
DAQDEKTVLEEFANFIQKDDVLVAHNGIDFDFIWINTKLDKYKLKPLDNPMLDSLRLAYQ
LYQFKRYTLENLSLKLGYEYDKTLAHRANYDTELLAKCLMIMLSQIYAKNWRSLLDLNDQ
EKLLNYLSEKSLKKAANLKINDEDNLDQITQSNENLFNRIRLRKAIVYAKNAQGLKALYK
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VLVPLPSLFKQDLYKKNIELTHVHDLINRIISICEQEKILYTFSSAAHYLKQEQKRFYDC
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ANLFNDEGLLPFPKKLHPPKIEGSDDKLIELVWNKAKELFGDEIDPIIKSRIEYELNAII
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SELTLNKKDEDLMPTYELYLEMLERNIKLEQVSLEHSDALHFVVKNNKIYPPFNTINGLG
DEIAKLIVKKRNEEGFKSQADLKTKCKLNKNIWNYFITYQVFGDLKEDEKIRLY