SPM_000905

Uniprot: A0A037UL54
Description: DNA polymerase III subunit alpha
EC number: 2.7.7.7
Annotation score: 2 out of 5
Miscellaneous [CC]:
Protein existence: Inferred from homology
Catalytic activity: CATALYTIC ACTIVITY: Deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1). {ECO:0000256|SAAS:SAAS00057091}.
Cofactor:
Enzyme regulation:
Function [CC]:
Pathway:
Active site:
Binding site:
Calcium binding:
DNA binding:
Metal binding:
Nucleotide binding:
Site:
Gene names (primary):
Gene names (synonym):
Mass: 117,168
Subunit structure [CC]:
Gene ontology (GO): 3'-5' exonuclease activity [GO:0008408]; DNA binding [GO:0003677]; DNA-directed DNA polymerase activity [GO:0003887]; DNA replication [GO:0006260]
Gene ontology IDs: GO:0003677; GO:0003887; GO:0006260; GO:0008408
Chain:
Signal peptide:
Domain [CC]:
Sequence similarities: SIMILARITY: Belongs to the DNA polymerase type-C family. {ECO:0000256|SAAS:SAAS00558490}.
Protein families: DNA polymerase type-C family
Coiled coil:
Domain [FT]: DOMAIN 4 70 POLIIIAc. {ECO:0000259|SMART:SM00481}.
Motif:
Region:
EMBL: AGBZ02000001
ProteinModelPortal:
MEROPS:
EnsemblBacteria KO: KAI92644
UniPathway:
CDD:
Gene3D:
HAMAP:
InterPro:
PANTHER: IPR011708;IPR029460;IPR004013;IPR003141;IPR004805
PIRSF:
PRINTS:
PROSITE:
Pfam:
ProDom: PF07733;PF14579;PF02811
SMART:
SUPFAM: SM00481
TIGRFAMs:

169739-172784(-)

>nucleotide sequence
TTATTCTTGCTCCCCACTAATAAACTTAATACGGTTAATAATCCCATTAATTTTATTATT
ATATGTTCCTAACTTAATATTTAATAATAATACATTATTAACTTTTAATAAATTAGCATA
ATCCTTATAGATACCAGCAAAAGCAGTAATACTAATTTCGCCACTTTCATCATAACAATC
TAAAAATGCCATTTTATTATTGTTTTTATCAGTAATTATTTTTAATCGCTTCACTAGAAT
TAAAACATTTGTTGATCCTAAACTTAAACGTAAATTACTAATTAATGTTGTTTTATCTTG
ATATCCTGCTTTTTCACGAATATATTTTAACGGATGATTTGATAAATAAAACCCTAAAAA
TTCATATTCTTTTTCTAAACAAATAACTTCATCGTTTGGTTCAATTACTAATTCTGGTTT
TTCAGCTAATGAAAAATCAACAACTAAATTTTCATTCTCTTCTTGAGTTTTAATTAACTC
AATGTAAGTAAGAATCCGTTGATAATTATTAAACAAAGTAATCCGGTTCAACTTAAAAAC
ATCTAATGCTCCGGAAAAACATAATGCTTCATAAGTTTTTCGATTTAAACCTTTTTTATA
CAGGCGAATAAACAAATCGTATAAATCCGTAAACATTCCATTAGTTTGATACTCTTGGGC
AATTTTATTAAAAAAAGCGAAACCAATTTGTTTAATAATTAATAATGGAACACAAATTTG
ATTATCAATAGTATGATATTGTCGATATGGAGCATTAATATTTGGTGGGACAATTGTTAA
ATGATTCTTTTTTGCTAAAGCAATATAATCATTTGTTTTATGTTCATCACCAATAACATG
TGTTAATAAACTAGCTAAAAACTGGGAAGGATAATTTGCTTTTAAATAGGCCATTTGATA
ACCTAATAATGAATATGCAACTGCATGGCTCCGATTAAACCCATAGGCAGCAAATTTATA
AATTAATTCTCAAATTTCTTGTGCTATTTTTTCAACATAATGATTTTTAACTGCTTCTTC
AATAAATTCAGTTTTCATTTGACTCATAATTGATGCATCTTTTTTTCCCATTGCACGACG
AAGCACATCAGCTTTAGCTAATGAAAAATTAGCAACTTTTTGAGCAATTAACATAACTTG
CTCTTGATAAACAATAATGCCATAAGTTGGTGCTAAAATTTCAGCTAACCGTTCATCAAT
ATAAGTAACTTTTGCTAAATTTTTTTTCCGTTTAATAAACAAGGGAATGTTATCTTGGGG
ACCAGGACGATATAACGAAGAAGTTGCAACAATATCCTCTAATTGGTCCGGAACCATATC
AACTAAAACTTTCGTCATCCCTGGTGATTCTAATTGAAAAATCCCTTTTGTATCTCCTTG
AGCTAATAATTGATAAGTTTTTTGATCATTTAATGGTAAAGTGTTAACATCTAATTTTAC
TTTTGTTTCTTGGTAAATATTATCAATCACATCATGTAAAATTGTTAAATTTCGTAATCC
TAATAAATCCATTTTTAAAATTCCCAATTCTTCTAAATAATTCATTGAATATTGCGTTTG
ATAAATTCCATTATAGCCTTCTTTAACTGGGATAATTGTTTGTAACCGTTGTTGCGTTAA
AACAACACCAGCCGCATGGGTTCCTGTTTGGCGTGGTAAACCAATAATTTTTTTTAAATG
TAAAAATACTTGGGGGTATTTTTTTTGATAAATTTCAAAAAGAGGATTTGAATTAATTGC
TTCTTCATAATGATAATTATATTCTAATGGAACTGCTTTGCTCATCTTGTCTGCTTCTTC
AATTGCAATATCAAAAATTCGGCAAATATCTCGAATTGCCATTTTCATTCCAATCGTTTG
AAAAGTGATAATATGTGCAACATGTTCACTCCCATATTTTTCAAATAAATATTCAACAAC
CATTTCTCGTTTATCATCTTCAAAATCAATATCAATATCTGGTAAACTTTTTCGCTCTGG
ATTTAAAAAGCGTTCAAACAGTAAATTATAGGTAATTGGATCAATTGTCGTAATATCTAA
TAAGTAACTAACTAAACTACCAGCAGCACTGCCTCGACCAGGCCCAACAAAAATATTTTG
TTGTTTTGCATAACGAACATAATCTCATACAATTAAAAAATAATCATTAAAACCCATTTT
ATTAATCACTGTTAATTCATAATTTAACCGCTCAAGATATGTTGTTTTAGAACTACTAAT
TCTTTTTTGTTTTAAAGCTGTTTGACAAATTTCTTGTAAAAACTGTTGTGCTGTTTGACC
TTCTGGGGTTGGATAACGTAATAAATTATCAAAAATAGTCCCTTTGTGTAAAGGAAAAAC
ATTAATTCCAGTAATAAATGTTTTAATATTGTCAAAATATTGTTGATAATGGGGTGGTGG
TGATACTCAACCATATAAATCTTTCATTTTACTTTCTTTAAATAAAGTTTGTGTTTTAAT
TGTATCAACAACTTTATAAGCAATAAAATCTTCACTTGTAAAATATTGTACTTTATTATT
TCAAATAATTTGTTCACTTGCAAGTAATGTTTGCAGTGACTCTAACAATGATAGATTGCC
ATTATTAATACCTAGATATAAATCTGTTTCAACTTTTAAAAGGTTCTTTAGCGTTTGATA
TAATTCAGGCTGATAATCATCTGTTGTATAATTAATAATAATCTTAACATCTGTTGTTAA
AAACTTGCTAATTTCATCTAATGTTACATTTTTTTTATGTTCAGTATTAATCATTACTAA
AGATGAAATTTCAACTAAATTAAAATAACCCTTTTGATTACGGGCAAATAAATTCATATT
ATAAGGAATATCATTAAATCAAATAATAACATTTAAGCCAATAATTGGTTTAATTTTATT
TTTTTGACAAAGTTGGTGAAATTCATAAACCCCAAACATATTATTATCACAAATTGCCAA
TGATGATAAACCCGTTGTCATAGCATAAGTAAAATATTTATCAAAAGTAATTAAAGATGA
TAATAAACTATAACTTGTTCGAACATTTAAATGGGGAATTGTCAT

>protein sequence
MTIPHLNVRTSYSLLSSLITFDKYFTYAMTTGLSSLAICDNNMFGVYEFHQLCQKNKIKP
IIGLNVIIWFNDIPYNMNLFARNQKGYFNLVEISSLVMINTEHKKNVTLDEISKFLTTDV
KIIINYTTDDYQPELYQTLKNLLKVETDLYLGINNGNLSLLESLQTLLASEQIIWNNKVQ
YFTSEDFIAYKVVDTIKTQTLFKESKMKDLYGWVSPPPHYQQYFDNIKTFITGINVFPLH
KGTIFDNLLRYPTPEGQTAQQFLQEICQTALKQKRISSSKTTYLERLNYELTVINKMGFN
DYFLIVWDYVRYAKQQNIFVGPGRGSAAGSLVSYLLDITTIDPITYNLLFERFLNPERKS
LPDIDIDFEDDKREMVVEYLFEKYGSEHVAHIITFQTIGMKMAIRDICRIFDIAIEEADK
MSKAVPLEYNYHYEEAINSNPLFEIYQKKYPQVFLHLKKIIGLPRQTGTHAAGVVLTQQR
LQTIIPVKEGYNGIYQTQYSMNYLEELGILKMDLLGLRNLTILHDVIDNIYQETKVKLDV
NTLPLNDQKTYQLLAQGDTKGIFQLESPGMTKVLVDMVPDQLEDIVATSSLYRPGPQDNI
PLFIKRKKNLAKVTYIDERLAEILAPTYGIIVYQEQVMLIAQKVANFSLAKADVLRRAMG
KKDASIMSQMKTEFIEEAVKNHYVEKIAQEIWELIYKFAAYGFNRSHAVAYSLLGYQMAY
LKANYPSQFLASLLTHVIGDEHKTNDYIALAKKNHLTIVPPNINAPYRQYHTIDNQICVP
LLIIKQIGFAFFNKIAQEYQTNGMFTDLYDLFIRLYKKGLNRKTYEALCFSGALDVFKLN
RITLFNNYQRILTYIELIKTQEENENLVVDFSLAEKPELVIEPNDEVICLEKEYEFLGFY
LSNHPLKYIREKAGYQDKTTLISNLRLSLGSTNVLILVKRLKIITDKNNNKMAFLDCYDE
SGEISITAFAGIYKDYANLLKVNNVLLLNIKLGTYNNKINGIINRIKFISGEQE