SPM_002405
  | Uniprot: A0A037UQR9
Description: DNA polymerase I EC number: 2.7.7.7 Annotation score: 2 out of 5 Miscellaneous [CC]: Protein existence: Inferred from homology Catalytic activity: CATALYTIC ACTIVITY: Deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1). {ECO:0000256|RuleBase:RU004460}. Cofactor: Enzyme regulation: Function [CC]: Pathway: Active site: Binding site: Calcium binding: DNA binding: Metal binding: Nucleotide binding: Site: Gene names (primary): Gene names (synonym): Mass: 100,271 Subunit structure [CC]: Gene ontology (GO): DNA binding [GO:0003677]; DNA-directed DNA polymerase activity [GO:0003887]; nuclease activity [GO:0004518]; DNA-dependent DNA replication [GO:0006261] Gene ontology IDs: GO:0003677; GO:0003887; GO:0004518; GO:0006261 Chain: Signal peptide: Domain [CC]: Sequence similarities: SIMILARITY: Belongs to the DNA polymerase type-A family. {ECO:0000256|RuleBase:RU004459}. Protein families: DNA polymerase type-A family Coiled coil: Domain [FT]: DOMAIN 2 259 53EXOc. {ECO:0000259|SMART:SM00475}.; DOMAIN 626 833 POLAc. {ECO:0000259|SMART:SM00482}. Motif: Region: EMBL: AGBZ02000001 ProteinModelPortal: MEROPS: EnsemblBacteria KO: KAI92866 UniPathway: CDD: Gene3D: HAMAP: 3.30.420.10;3.40.50.1010 InterPro: PANTHER: IPR020046;IPR020045;IPR002421;IPR019760;IPR001098;IPR018320;IPR002298;IPR008918;IPR029060;IPR012337 PIRSF: PRINTS: PROSITE: PR00868 Pfam: PS00447 ProDom: PF01367;PF02739;PF00476 SMART: SUPFAM: SM00475;SM00279;SM00482 TIGRFAMs: SSF47807;SSF53098;SSF88723 |
444336-446946(-) >nucleotide sequence TTTAGTAGAATCTTCCATTAATGTTTTAACAATTTTTTGCACTTGAATTAATTCAACTTG CGGAATTTCAAAAATTAATTCATCATGAATTTGTGCAATAATTTTTGCTTTTAAATTTAA TTTTAAAAACTCTTGGTCAATATTTTTTAAAGCAATTTTAATAATATCTGCCGCACTACC TTGAATTGGCATATTCATTGCAATTCGCTTTCCAAATTCACGTTGCATATAATTCCGATC ATTAATTTCTGGAACATAACGTTTTCGATTAAAAATTGTTGTAACATAGCCATTTTGTTT ACAAAACTCAACTTGTTTATCAATAAAAGCCTTAATTGTTGGAAATTGCTGATAATAATT ATTGATTATTGCTTTTGCTTTTGCAACAGAAATATTTAAATCAGTTGCTAAACCAAAGTC ACTAATTCCATAAATAATACCAAAATTAACAGCTTTTGCACTACGACGAATATTTGGAGT AATTTCATCTTTTGATAAATTAAAAATTTTCATTGCAGTATTAGTATGAATATCTTCATT ATTATTAAAAGCAGCAATTAAATCTTGGTCTTTTGACATATGTGCCAAAATTCGTAATTC AATTTGTGAATAATCACAAGATAATAAAATATTATCTGGTGATGAAACAACAAAAATTTT TCGTACCTCTTTTTGGATATCATCACGAATACTAATATTTTGCATATTAGGTTCCACAGA TGAAAGTCTGCCAGTATTTGTTAAGGTTTGTTTATAAATTGTATGAACTTTCCCATCAGC AAAAATATATTTTTCCATCCCTTTTAAATAAGTTGAATATAATTTTTGATATTTTCGATA ATCTAAGATCTTTGGAATAATTACATGGTTATTTTTTATTTCTTCTAAAGTTTCTTGTGC TGTTGATCCTTTTTTCCGATCAGGTAAGGAAAAATCTTGAAATAATAATTCTGAAATTTG TTTTGGAGAATTAGGATTAATTTCTTTTTGTGCAATATCATTAATTTCATTATTTAATTC TTGAACAATTTTTTCAATTCGTAAGGTTTGTGTTGTTAATTCATATTGGTCAACTTTAAC ACCATTAATTTCCATTCGTGCTAATGCAAAAGCAGTTGGTAACTCAATATTATGATACAA ATCATATTGTTGATTAGTTTTTAATAACTCAATAATTTTTGGTCTTAATTTATGAATATA TGCTGCTTTTTCGCCAATAAAGTGACCTAATTTAATTACATCAGCAGGAATTTGTTTTTT AACCCCTTTTCCATAAAATAATTCATCAGTTAAAATTTGTTTTTTCTCAAATAAATTAAT ATAAGTATCTAAACTATTTTTTGCATTTGAATTATAAACATAACCAGCCAACATCATATC ATACTCAATATTTTGAACAAAAATATTATCACGAGCTAGAGCAACAATTAAACTTTTTGC ATGATAAGTTAACTTTTGATATTTATTATCATTTAAAAATTGATGTCATAGTTTATCATG CTTTGCATGAATATAATCAAAATAAAAAACGCCTTTGGAATTAACAATTCCAAATCCAAT AATTTCCGAAGTATGATAATTTTCATCTAATAGTTCTAAATACACAGTAGTATTGTTTTC ATTAAATTCAGAACGTCATTCTTCAATAATTTTTACTTTTATATTTGAGTTTTGGATATC ATTATCTTGATTATTAAATAGTTTTGTTACAAATGAATTCATATTATATTTTAAATAAAA TTGCATTAATGTTTCCTGATTTGGTGAAAATGGAGTGAAAGTAAAATGCTCTAAATTAAT ATCACAAAAAATAGTAGCTATTTTTTTGCACAATAATGCACTTTCTTTATGATTCAATAA ATTTTGTTGTAAAGCACCCTTAATATGTTCAATATTATCATATAAATTTTCAATTGAATG ATATTCCTTAATTAATTTTATTGCTGTTTTTTCGCCAACTTTTGGAACACCCTTTAAATT ATCGGAAGGGTCACCCATTAGCCCTTTTAAATCAGGAACTTGTAATGGTTTAATTCCCCA TTTTGCTATTAAAGCAGCTTCATCAATAACATCAGCACTATCGCCTTGACGTGGCACTAA AATATTTGTTTTATTAGTAATTAGTTGGTATAAATCCTTATCACTGGAAAAAATATCAAC ATAAAAATCTTCTTTTTCAGCCAACATTGCTAAACATCCTAATAGATCATCAGCCTCATA TCCTTCTTGCTCTAAATATGGAATTTGATAACTATCTAAAAATTCCTTTACAATTGGAAA TTGTACAATTAATTCATTTGGTGTTTTGCTCCGACCATCTTTGTAGTCAACTAATAAATC ATGACGAAAATTCTTTTTTCCTTTATCAAAAGCAACAACAACACTATAGTAGTTATTTGC TTTTAATATTTTATTTAACATATTGGCAAATGCATAAACAGCATTTGTTGGTGTTCCATC CAAACTTTTTAACATCTCGCCATTATAAGCTGTGGCATAAAATGCTCTAAAAAGCAAAGA ATTTCCATCAATTAACAATACTTTTTTCAT >protein sequence FDKGKKNFRHDLLVDYKDGRSKTPNELIVQFPIVKEFLDSYQIPYLEQEGYEADDLLGCL AMLAEKEDFYVDIFSSDKDLYQLITNKTNILVPRQGDSADVIDEAALIAKWGIKPLQVPD LKGLMGDPSDNLKGVPKVGEKTAIKLIKEYHSIENLYDNIEHIKGALQQNLLNHKESALL CKKIATIFCDINLEHFTFTPFSPNQETLMQFYLKYNMNSFVTKLFNNQDNDIQNSNIKVK IIEEWRSEFNENNTTVYLELLDENYHTSEIIGFGIVNSKGVFYFDYIHAKHDKLWHQFLN DNKYQKLTYHAKSLIVALARDNIFVQNIEYDMMLAGYVYNSNAKNSLDTYINLFEKKQIL TDELFYGKGVKKQIPADVIKLGHFIGEKAAYIHKLRPKIIELLKTNQQYDLYHNIELPTA FALARMEINGVKVDQYELTTQTLRIEKIVQELNNEINDIAQKEINPNSPKQISELLFQDF SLPDRKKGSTAQETLEEIKNNHVIIPKILDYRKYQKLYSTYLKGMEKYIFADGKVHTIYK QTLTNTGRLSSVEPNMQNISIRDDIQKEVRKIFVVSSPDNILLSCDYSQIELRILAHMSK DQDLIAAFNNNEDIHTNTAMKIFNLSKDEITPNIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLATDLNI SVAKAKAIINNYYQQFPTIKAFIDKQVEFCKQNGYVTTIFNRKRYVPEINDRNYMQREFG KRIAMNMPIQGSAADIIKIALKNIDQEFLKLNLKAKIIAQIHDELIFEIPQVELIQVQKI VKTLMEDSTKLDVKLIVDMKTGLSWYDLK |
© Fisunov Lab of Proteomics, 2016.