SPM_002405


  Uniprot: A0A037UQR9
Description: DNA polymerase I
EC number: 2.7.7.7
Annotation score: 2 out of 5
Miscellaneous [CC]: 
Protein existence: Inferred from homology
Catalytic activity: CATALYTIC ACTIVITY: Deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1). {ECO:0000256|RuleBase:RU004460}.
Cofactor: 
Enzyme regulation: 
Function [CC]: 
Pathway: 
Active site: 
Binding site: 
Calcium binding: 
DNA binding: 
Metal binding: 
Nucleotide binding: 
Site: 
Gene names (primary): 
Gene names (synonym): 
Mass: 100,271
Subunit structure [CC]: 
Gene ontology (GO): DNA binding [GO:0003677]; DNA-directed DNA polymerase activity [GO:0003887]; nuclease activity [GO:0004518]; DNA-dependent DNA replication [GO:0006261]
Gene ontology IDs: GO:0003677; GO:0003887; GO:0004518; GO:0006261
Chain: 
Signal peptide: 
Domain [CC]: 
Sequence similarities: SIMILARITY: Belongs to the DNA polymerase type-A family. {ECO:0000256|RuleBase:RU004459}.
Protein families: DNA polymerase type-A family
Coiled coil: 
Domain [FT]: DOMAIN 2 259 53EXOc. {ECO:0000259|SMART:SM00475}.; DOMAIN 626 833 POLAc. {ECO:0000259|SMART:SM00482}.
Motif: 
Region: 
EMBL: AGBZ02000001
ProteinModelPortal: 
MEROPS: 
EnsemblBacteria KO: KAI92866
UniPathway: 
CDD: 
Gene3D: 
HAMAP: 3.30.420.10;3.40.50.1010
InterPro: 
PANTHER: IPR020046;IPR020045;IPR002421;IPR019760;IPR001098;IPR018320;IPR002298;IPR008918;IPR029060;IPR012337
PIRSF: 
PRINTS: 
PROSITE: PR00868
Pfam: PS00447
ProDom: PF01367;PF02739;PF00476
SMART: 
SUPFAM: SM00475;SM00279;SM00482
TIGRFAMs: SSF47807;SSF53098;SSF88723
444336-446946(-)

>nucleotide sequence
TTATTTTAAATCATATCAGCTTAAACCAGTTTTCATATCAACTATTAACTTTACATCTAA
TTTAGTAGAATCTTCCATTAATGTTTTAACAATTTTTTGCACTTGAATTAATTCAACTTG
CGGAATTTCAAAAATTAATTCATCATGAATTTGTGCAATAATTTTTGCTTTTAAATTTAA
TTTTAAAAACTCTTGGTCAATATTTTTTAAAGCAATTTTAATAATATCTGCCGCACTACC
TTGAATTGGCATATTCATTGCAATTCGCTTTCCAAATTCACGTTGCATATAATTCCGATC
ATTAATTTCTGGAACATAACGTTTTCGATTAAAAATTGTTGTAACATAGCCATTTTGTTT
ACAAAACTCAACTTGTTTATCAATAAAAGCCTTAATTGTTGGAAATTGCTGATAATAATT
ATTGATTATTGCTTTTGCTTTTGCAACAGAAATATTTAAATCAGTTGCTAAACCAAAGTC
ACTAATTCCATAAATAATACCAAAATTAACAGCTTTTGCACTACGACGAATATTTGGAGT
AATTTCATCTTTTGATAAATTAAAAATTTTCATTGCAGTATTAGTATGAATATCTTCATT
ATTATTAAAAGCAGCAATTAAATCTTGGTCTTTTGACATATGTGCCAAAATTCGTAATTC
AATTTGTGAATAATCACAAGATAATAAAATATTATCTGGTGATGAAACAACAAAAATTTT
TCGTACCTCTTTTTGGATATCATCACGAATACTAATATTTTGCATATTAGGTTCCACAGA
TGAAAGTCTGCCAGTATTTGTTAAGGTTTGTTTATAAATTGTATGAACTTTCCCATCAGC
AAAAATATATTTTTCCATCCCTTTTAAATAAGTTGAATATAATTTTTGATATTTTCGATA
ATCTAAGATCTTTGGAATAATTACATGGTTATTTTTTATTTCTTCTAAAGTTTCTTGTGC
TGTTGATCCTTTTTTCCGATCAGGTAAGGAAAAATCTTGAAATAATAATTCTGAAATTTG
TTTTGGAGAATTAGGATTAATTTCTTTTTGTGCAATATCATTAATTTCATTATTTAATTC
TTGAACAATTTTTTCAATTCGTAAGGTTTGTGTTGTTAATTCATATTGGTCAACTTTAAC
ACCATTAATTTCCATTCGTGCTAATGCAAAAGCAGTTGGTAACTCAATATTATGATACAA
ATCATATTGTTGATTAGTTTTTAATAACTCAATAATTTTTGGTCTTAATTTATGAATATA
TGCTGCTTTTTCGCCAATAAAGTGACCTAATTTAATTACATCAGCAGGAATTTGTTTTTT
AACCCCTTTTCCATAAAATAATTCATCAGTTAAAATTTGTTTTTTCTCAAATAAATTAAT
ATAAGTATCTAAACTATTTTTTGCATTTGAATTATAAACATAACCAGCCAACATCATATC
ATACTCAATATTTTGAACAAAAATATTATCACGAGCTAGAGCAACAATTAAACTTTTTGC
ATGATAAGTTAACTTTTGATATTTATTATCATTTAAAAATTGATGTCATAGTTTATCATG
CTTTGCATGAATATAATCAAAATAAAAAACGCCTTTGGAATTAACAATTCCAAATCCAAT
AATTTCCGAAGTATGATAATTTTCATCTAATAGTTCTAAATACACAGTAGTATTGTTTTC
ATTAAATTCAGAACGTCATTCTTCAATAATTTTTACTTTTATATTTGAGTTTTGGATATC
ATTATCTTGATTATTAAATAGTTTTGTTACAAATGAATTCATATTATATTTTAAATAAAA
TTGCATTAATGTTTCCTGATTTGGTGAAAATGGAGTGAAAGTAAAATGCTCTAAATTAAT
ATCACAAAAAATAGTAGCTATTTTTTTGCACAATAATGCACTTTCTTTATGATTCAATAA
ATTTTGTTGTAAAGCACCCTTAATATGTTCAATATTATCATATAAATTTTCAATTGAATG
ATATTCCTTAATTAATTTTATTGCTGTTTTTTCGCCAACTTTTGGAACACCCTTTAAATT
ATCGGAAGGGTCACCCATTAGCCCTTTTAAATCAGGAACTTGTAATGGTTTAATTCCCCA
TTTTGCTATTAAAGCAGCTTCATCAATAACATCAGCACTATCGCCTTGACGTGGCACTAA
AATATTTGTTTTATTAGTAATTAGTTGGTATAAATCCTTATCACTGGAAAAAATATCAAC
ATAAAAATCTTCTTTTTCAGCCAACATTGCTAAACATCCTAATAGATCATCAGCCTCATA
TCCTTCTTGCTCTAAATATGGAATTTGATAACTATCTAAAAATTCCTTTACAATTGGAAA
TTGTACAATTAATTCATTTGGTGTTTTGCTCCGACCATCTTTGTAGTCAACTAATAAATC
ATGACGAAAATTCTTTTTTCCTTTATCAAAAGCAACAACAACACTATAGTAGTTATTTGC
TTTTAATATTTTATTTAACATATTGGCAAATGCATAAACAGCATTTGTTGGTGTTCCATC
CAAACTTTTTAACATCTCGCCATTATAAGCTGTGGCATAAAATGCTCTAAAAAGCAAAGA
ATTTCCATCAATTAACAATACTTTTTTCAT


>protein sequence
MKKVLLIDGNSLLFRAFYATAYNGEMLKSLDGTPTNAVYAFANMLNKILKANNYYSVVVA
FDKGKKNFRHDLLVDYKDGRSKTPNELIVQFPIVKEFLDSYQIPYLEQEGYEADDLLGCL
AMLAEKEDFYVDIFSSDKDLYQLITNKTNILVPRQGDSADVIDEAALIAKWGIKPLQVPD
LKGLMGDPSDNLKGVPKVGEKTAIKLIKEYHSIENLYDNIEHIKGALQQNLLNHKESALL
CKKIATIFCDINLEHFTFTPFSPNQETLMQFYLKYNMNSFVTKLFNNQDNDIQNSNIKVK
IIEEWRSEFNENNTTVYLELLDENYHTSEIIGFGIVNSKGVFYFDYIHAKHDKLWHQFLN
DNKYQKLTYHAKSLIVALARDNIFVQNIEYDMMLAGYVYNSNAKNSLDTYINLFEKKQIL
TDELFYGKGVKKQIPADVIKLGHFIGEKAAYIHKLRPKIIELLKTNQQYDLYHNIELPTA
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SLPDRKKGSTAQETLEEIKNNHVIIPKILDYRKYQKLYSTYLKGMEKYIFADGKVHTIYK
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© Fisunov Lab of Proteomics, 2016.