SPM_005625

Uniprot: A0A037UR81
Description: DNA polymerase III subunit alpha
EC number: 2.7.7.7
Annotation score: 2 out of 5
Miscellaneous [CC]:
Protein existence: Inferred from homology
Catalytic activity: CATALYTIC ACTIVITY: Deoxynucleoside triphosphate + DNA(n) = diphosphate + DNA(n+1). {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356, ECO:0000256|SAAS:SAAS00057091}.
Cofactor:
Enzyme regulation:
Function [CC]: FUNCTION: Required for replicative DNA synthesis. This DNA polymerase also exhibits 3' to 5' exonuclease activity. {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356, ECO:0000256|SAAS:SAAS00229340}.
Pathway:
Active site:
Binding site:
Calcium binding:
DNA binding:
Metal binding:
Nucleotide binding:
Site:
Gene names (primary): polC
Gene names (synonym):
Mass: 166,754
Subunit structure [CC]:
Gene ontology (GO): cytoplasm [GO:0005737]; 3'-5' exonuclease activity [GO:0008408]; DNA binding [GO:0003677]; DNA-directed DNA polymerase activity [GO:0003887]; DNA-dependent DNA replication [GO:0006261]
Gene ontology IDs: GO:0003677; GO:0003887; GO:0005737; GO:0006261; GO:0008408
Chain:
Signal peptide:
Domain [CC]:
Sequence similarities: SIMILARITY: Belongs to the DNA polymerase type-C family. PolC subfamily. {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356, ECO:0000256|SAAS:SAAS00556408}.; SIMILARITY: Contains exonuclease domain. {ECO:0000256|SAAS:SAAS00242420}.
Protein families: DNA polymerase type-C family, PolC subfamily
Coiled coil:
Domain [FT]: DOMAIN 620 734 PI-PLC X-box. {ECO:0000259|PROSITE:PS50007}.
Motif:
Region:
EMBL: AGBZ02000004
ProteinModelPortal:
MEROPS:
EnsemblBacteria KO: KAI92210
UniPathway:
CDD:
Gene3D:
HAMAP: 3.30.420.10
InterPro: MF_00356
PANTHER: IPR011708;IPR024754;IPR029460;IPR006054;IPR013520;IPR004013;IPR000909;IPR003141;IPR016195;IPR006308;IPR012337
PIRSF:
PRINTS:
PROSITE:
Pfam: PS50007
ProDom: PF11490;PF07733;PF14579;PF02811;PF00929
SMART:
SUPFAM: SM00479;SM00481
TIGRFAMs: SSF53098;SSF89550

184947-189306(+)

>nucleotide sequence
ATGGACCAACAATTGATAAAACTATTTACAGCAAATAATTTAGAATTTACCGGAAATTAT
TTTGATGATGCTAAAGTCATTAAAGCAGAATATAGTACTAGTGAAGGTTTTTTTCGTGTT
GTTATTGAAATTAATGATTTTTTACCGCCAGAAGTTTTACTAAAATTAGAACAAACTTTA
TTAGAAAATCAAACATTACCCACAAAGATTTCTTTACGGGTTCGAAAAGAACAATATGAA
TTAGCAACTATTTTTAGTTATTTAGAATATATTCGGTTAAATAAATCGGAATTAAAAAAT
AGTTTTTTTAGTAAATTATCCCCAGAGCGATTTGCTTTAACTGATAATATTTTAAAAATT
ACTGTTCATTCAGAAAGTGAACAAAAATTAGTAGGTGAGCATTGTAATTATTATCAAAAA
AAACTTCGTCGTTATGGTTTTAGTGATTTACAATTAGCTCTAGTGATTGATTTACGGGAA
AATAATATTTTAGAAATTAACGAACAAGAATTAATTAAATATCAAGAAACAGCGCAAAAA
ACAGAACAGTTAATTTCAAAGCCAACAAATGGCGCTAATTCTGTTCGAAGAGAACCGAAT
AGTTATCATAGAGCAAAAATTGGAGAAGCAAGTTATGAACGATTAATTGATATTGACCAA
GATGTTCCCAATGTTACAATTTATGGAAAAATTTTGAGTAAAGAACGGCAATTAATTTCA
ACAAAAAAATTTATTTATGTAATAACAGTTACTGATTATAGTGATACAATTGGCGCAAAG
TTTTTTACTCGAACAGAACAACCAGATGATTTTATTGAAGAATTAAAAACTAATGAATGA
GTTAGTCTTTTTGGTGATATTCGGTATGATACTTATGCGAATGAACAAATGTTTTTTATT
AAAAAAATTTCTCGTTTAGATCGCGAAGACTTGTATCGTGAAGATAATGCGCCTGAGAAA
CGCATAGAGTTACATTTACATACTAAAATGAGTGTTATGGATGGAGTAACAGATCTTGCA
ATGCTTTTTAAAACATTACAGCATTGGAATCATAAAGCAATTGCTTTTACTGACCATTTA
AATGTTCAAGCTTATCCGGAAATTTATAATCTTAATAAGAAATATCCCGATATTAAAGTT
ATTTATGGTGTTGAAGCAGATGTTTTAGATGATAAAGTATGATATGTTAAAAACCCTCAT
CACCATAATTTACGAACTGCAAAATATGTTATTTTTGACTTAGAAACAACTGGCTTAAGT
AGTAGTTATGATGAAATTATTGAGTTTGGAGCCGTTATCATGGATGGTATTAGTGGTGAA
CGCCAAACAATTAATCATCTGTTCAAACCATCAGTTAAGTTATCATCATTTACAACCGAA
TTAACAGGAATTACTGATGAATTATTAGCTGATAAACCAACTTTTATTGAATCAATTGAC
CAAATTTTAGAATATTTTAAGGATGCAATTTTAATTGCGCATAATGCTGAGTTTGACCTT
GGTTTTATTCAATCATGGTTAAAAAAAGCTGGGCGCTCAGAAATTAATAATACAGTAATT
GATACTTTACAATTATCACGGATTTTAGAACCACATTTGAAAAATTATCGCTTGGGAACA
ATTGCTCGTTGTTATAGTGTTATTTATAATGAAGAAGTTGCTCACCGTGGTGATTATGAT
GCAATTGTTTTAACTGACATTTATGAACATCAACTACGGAAAATGATTAATAATTATGGT
ATTGAGTTTGATAATGACATTGAGAATATTCATGACCCGGCTGTTTACAAAAAATTGCGA
CCAAAACATATGACAATTTTAGCAAAAAATCAGGCGGGCTTATTGGAATTATTTAAATTA
ATAACTGCTGCACATACTAAATATTTTTACTCATCACCAAAATTATTACGAAGTGTAATT
GAACAACATCGTAGTAATTTATTAATTGGGTCATCGTGTGTTAACGGTGATGTTTTTGAA
GTGGCACGAAATAAAGATTTATCGGAATTACGAGAAACAATTAAGTTTTATGATTATATT
GAAGTTCAACCCCCAAGTGTATATAAACATTTAGTCCAAATGGGTGATTTGTCAGAAGAA
CGACTATTAACGGTAATCAAAGATATTGTTTTTACAGCAAAAGAATTAAATAAATTAGTT
GTTGCTACTGGTGATGTTCATTATCTTAATCCAGAAGATAAAATTTTTCGTGAAGTTTAT
ATTAATGCAAAAGGAATTGGGGGCCGACCACATCCTTTATATGACTATAAGCAACGAGTA
ACGGATAATCCTGATCAGTTTTTAAGAACAACAATGGAAATGATGAACGAATTTAAGTTT
TTAAATGATGATGAATTAATTTATGAAATTGTAGTAACAAATCCAAATTTAATTTCTGAC
CAAATTGAAAAAGTTGAAATTATTAAAGATAAATTATATACGCCTAAGATTAAGGGTAGT
GACCAATTATTAAAAGAATTATGTTATCAAAATGCTTATAAAATTTATGGTAATCCATTG
CCAGAAATTGTTGCTTCCCGTTTAGAACGAGAATTAAATGCTATTATTAAACATGGTTTT
GCTGTTATTTACTGAATTGCGCATAAATTAGTTGATAAATCATTACAAGATGGTTATTTA
GTTGGGTCGCGGGGAAGCGTTGGTAGTAGTTTTGTTGCAACAATGAGTAATATTACCGAA
GTAAATCCATTACAACCACATTATTTATGTTCTTATTGTAGTTATAGTGAATTTATTGTT
GATGGATCGGTTAAGTGTGGATATGATTTATCAGCTCGTACTTGTCCAAAGTGTCAAAAA
CCATTAAAAGGGGAAGGACATGATATTCCATTTGAAACATTTTTAGGGTTTGAAGCGGAT
AAAGTTCCTGATATTGATTTAAACTTTTCAGGAGAATATCAACCAATTGCGCATGATTTT
ACCAAAGAAATGTTTGGCGAGCGTAGTGTTTATCGTGCGGGAACAATTTCCACAGTGGCA
GAAAAAACTGCATATGGTTATGTGAAAGGTTATTTTGAAAGTAAAAATATTTTACATTTA
AAACGCCGCGCAGAATTAGAACGAATTGCTAAGGGTTGTGAAGGGGTTAAACGAACAACT
GGCCAGCATCCAGGTGGAATTGTTGTTATTCCAAATGAATATGAAGTTGAAGCGTTTACA
CCAGTTAATTTTCCTGCTGATGATATAAAATCAAATTGGTTAACTACTCATTTTGATTTC
CACGCAATTCATGATAATGTTTTAAAGTTAGATATTTTAGGTCATGTTGATCCAACTGCT
TTGCGAATGCTACAAGATTTAACGGGAGTGGATCCAAAAACAATTCCAACAAATGATGAA
GCGGTTTTAAGTCTTTTTCGAAGTTTAGATGTTTTAAACATTAAACCAGAAGATATTAAT
GGTGAAAAAACTGGCGCAATTGGCATTCCTGAATTTGGTACTTTTTTTGTTCGTAAGATG
CTATTAGATACAAAACCTACTTCATTTGCAGATTTAGTTCAAATTTCAGGATTATCACAT
GGAACAGATGTTTGAATTGGTAATGCCCAAGAATTAATTCGAAATCAAAATATTAGTATC
TCAGAAGTAATTGGGTGTCGTGATGACATTATGGTTAATTTAATTTATAAAGGGTTACCT
GCTCAAAGTGCTTTTAAGATTATGGAAGATGTTCGTAAGGGAAAAGGTTTAACAGCTGAA
CATGAGCAATTAATGCGGGATAATAATGTTGAACAATGATATATTGATTCATGTAATAAA
ATTAAGTATATGTTCCCAAAAGCACATGCAACAGCCTATGTTTTAATGGCATGACGGGTG
GCATGATACAAAATTAATTACCCAGTTGAATATTATGCAACATTTTTTTCAACTCGAACA
GATGTTTTTGACATTAAAACAATTTTAAAAGGAGCAGAAACAATCAAACAAGTATTAAGA
GATATTCAAACTCGGTTGGATAATAAAGATTTTAATGCACCGAATAAACCAACTCAAAAA
GAAAAAGATTTAATTCCAGTTTATGAAATAGCATTAGAAATGTATGCCCGAGGAATTAAA
ATGAGTAATATTGATTTAAAAACAAGTCGCAATAAAAATTTTACGGTTATTACAACTGAA
AATAATGAAAAAATTATTTTACCACCATTTTCGGCAATTGATGGCTTGGGAGGTGCTGTT
GGTGATAGTATTATTAATGCTCGTTATGAAAAACCATTTTTATCAGTTGCTGATTTACAA
AAACGAACAAATATTACAAAGGCTCATTTAGAATCATTTGAAGAACTTGGAATTTTAAAA
GATTTATCGTTAGATGATCAAATTGCTTTTGAGTTTTAA

>protein sequence
MDQQLIKLFTANNLEFTGNYFDDAKVIKAEYSTSEGFFRVVIEINDFLPPEVLLKLEQTL
LENQTLPTKISLRVRKEQYELATIFSYLEYIRLNKSELKNSFFSKLSPERFALTDNILKI
TVHSESEQKLVGEHCNYYQKKLRRYGFSDLQLALVIDLRENNILEINEQELIKYQETAQK
TEQLISKPTNGANSVRREPNSYHRAKIGEASYERLIDIDQDVPNVTIYGKILSKERQLIS
TKKFIYVITVTDYSDTIGAKFFTRTEQPDDFIEELKTNEWVSLFGDIRYDTYANEQMFFI
KKISRLDREDLYREDNAPEKRIELHLHTKMSVMDGVTDLAMLFKTLQHWNHKAIAFTDHL
NVQAYPEIYNLNKKYPDIKVIYGVEADVLDDKVWYVKNPHHHNLRTAKYVIFDLETTGLS
SSYDEIIEFGAVIMDGISGERQTINHLFKPSVKLSSFTTELTGITDELLADKPTFIESID
QILEYFKDAILIAHNAEFDLGFIQSWLKKAGRSEINNTVIDTLQLSRILEPHLKNYRLGT
IARCYSVIYNEEVAHRGDYDAIVLTDIYEHQLRKMINNYGIEFDNDIENIHDPAVYKKLR
PKHMTILAKNQAGLLELFKLITAAHTKYFYSSPKLLRSVIEQHRSNLLIGSSCVNGDVFE
VARNKDLSELRETIKFYDYIEVQPPSVYKHLVQMGDLSEERLLTVIKDIVFTAKELNKLV
VATGDVHYLNPEDKIFREVYINAKGIGGRPHPLYDYKQRVTDNPDQFLRTTMEMMNEFKF
LNDDELIYEIVVTNPNLISDQIEKVEIIKDKLYTPKIKGSDQLLKELCYQNAYKIYGNPL
PEIVASRLERELNAIIKHGFAVIYWIAHKLVDKSLQDGYLVGSRGSVGSSFVATMSNITE
VNPLQPHYLCSYCSYSEFIVDGSVKCGYDLSARTCPKCQKPLKGEGHDIPFETFLGFEAD
KVPDIDLNFSGEYQPIAHDFTKEMFGERSVYRAGTISTVAEKTAYGYVKGYFESKNILHL
KRRAELERIAKGCEGVKRTTGQHPGGIVVIPNEYEVEAFTPVNFPADDIKSNWLTTHFDF
HAIHDNVLKLDILGHVDPTALRMLQDLTGVDPKTIPTNDEAVLSLFRSLDVLNIKPEDIN
GEKTGAIGIPEFGTFFVRKMLLDTKPTSFADLVQISGLSHGTDVWIGNAQELIRNQNISI
SEVIGCRDDIMVNLIYKGLPAQSAFKIMEDVRKGKGLTAEHEQLMRDNNVEQWYIDSCNK
IKYMFPKAHATAYVLMAWRVAWYKINYPVEYYATFFSTRTDVFDIKTILKGAETIKQVLR
DIQTRLDNKDFNAPNKPTQKEKDLIPVYEIALEMYARGIKMSNIDLKTSRNKNFTVITTE
NNEKIILPPFSAIDGLGGAVGDSIINARYEKPFLSVADLQKRTNITKAHLESFEELGILK
DLSLDDQIAFEF